Jorge Alexander Duitama Castellanos

Grupo:: Research Group:

TICSw-Tecnologías de Información y Construcción de Software

Contacto:

Oficina: Office: ML 622

Correo: Email:

Extensión: Extension: 1686

Ingeniería de sistemas y computación, Universidad de los Andes, Colombia
Magíster en ingeniería de sistemas y computación. Universidad de los Andes, Colombia
Ph.D. en ciencias de computación e ingeniería, University of Connecticut, Estados Unidos

Intereses y líneas de Investigación:

Bioinformática

Grupo:: Research Group:

TICSw-Tecnologías de Información y Construcción de Software

Filtrar

Tipo de publicación:

A partir de:

Análisis de pangenoma de Leishmania (Viannia) panamensis Tesis

2026

.(2026). Análisis de pangenoma de Leishmania (Viannia) panamensis.Trabajo Dirigido por: Duitama J - 2026
Breast cancer clustering integrating complete gene expression profiles and genetic ancestry Artículo

2026

Stepanian J, Mejia-garcia A, Orozco C, Duitama J. (2026) Breast cancer clustering integrating complete gene expression profiles and genetic ancestry. PLoS ONE (ISSN 1932-6203) 21 (7), pp. e0352514-e0352514. - 2026
High Genetic Diversity of Phytophthora palmivora in Colombian Cacao: Evidence Against Geographic Barriers Artículo

2026

Duitama J, Restrepo S. (2026) High Genetic Diversity of Phytophthora palmivora in Colombian Cacao: Evidence Against Geographic Barriers. Phytopathology (ISSN 0031-949X) 1 (1), pp. 1-1. - 2026
New algorithms for unsupervised cell clustering from scRNA-seq data Artículo

2026

Robles M, Diaz J, Cristhian Forigua, Quiroz A, Duitama J. (2026) New algorithms for unsupervised cell clustering from scRNA-seq data. Bioinformatics Advances (ISSN 2635-0041) 6 (1), pp. vbag121-vbag121. - 2026
Algoritmo de encadenamiento de coincidencias basado en entropías para el mapeo de lecturas largas Tesis

2025

.(2025). Algoritmo de encadenamiento de coincidencias basado en entropías para el mapeo de lecturas largas.Trabajo Dirigido por: Duitama J - 2025
Análisis de datos de expresión génica para diagnóstico y tipificación de cáncer de próstata Tesis

2025

.(2025). Análisis de datos de expresión génica para diagnóstico y tipificación de cáncer de próstata.Trabajo Dirigido por: Duitama J - 2025
Análisis transcriptómico de Scedosporium apiospermum y ensamblaje preliminar de Scenedesmus dimorphus como herramientas microbianas para biodegradación de fenol Tesis

2025

.(2025). Análisis transcriptómico de Scedosporium apiospermum y ensamblaje preliminar de Scenedesmus dimorphus como herramientas microbianas para biodegradación de fenol.Trabajo Dirigido por: Duitama J - 2025
Conservando el gigante del Caribe: Ensamblaje denovo del Genoma del Mero Guasa (Epinephelus itajara) y su estructura poblacional, en el PNN Corales del Rosario y de San Bernardo Tesis

2025

.(2025). Conservando el gigante del Caribe: Ensamblaje denovo del Genoma del Mero Guasa (Epinephelus itajara) y su estructura poblacional, en el PNN Corales del Rosario y de San Bernardo.Trabajo Dirigido por: Duitama J, Caballero S - 2025
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR Tesis

2025

.(2025). Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR.Trabajo Dirigido por: Duitama J - 2025
Evidence of long-distance clonal spreading and low genomic diversity of Kikuyu grass from highland livestock farms after a century of intentional introduction in Colombia Artículo

2025

Cerón-souza I, Castillo-sierra J, Reyes-herrera P, Berdugo-cely J, Parra-salazar A, Lozano-arce D, Duitama J, Avellaneda Y, Jesús J. (2025) Evidence of long-distance clonal spreading and low genomic diversity of Kikuyu grass from highland livestock farms after a century of intentional introduction in Colombia. Crop Science (ISSN 0011-183X) 65 (3), pp. e70086-e70086. - 2025
Genetic diversity and comparative genomics across Leishmania (Viannia) species Artículo

2025

Gonzalez-Garcia L, Maria Paula Rodriguez, Parra-muñoz M, Clavijo A, Levy L, Ovalle-bracho C, Colorado C, Camargo C, Quiceno E, Moncada M, Muskus C, Urrea D, Baez-aguirre F, Restrepo S, Echeverry M, Duitama J. (2025) Genetic diversity and comparative genomics across Leishmania (Viannia) species. Communications Biology (ISSN 2399-3642) 8 (1), pp. 925-925. - 2025
Genomic characterization of Leishmania (V.) braziliensis associated with antimony therapeutic failure and variable in vitro tolerance to amphotericin B Artículo

2025

Gonzalez-garcia L, Rodríguez-guzmán A, Vargas-león C, Aponte S, Bonilla-valbuena L, Manuel J, Clavijo-vanegas A, Duarte-olaya G, Aguilar-buitrago C, Urrea D, Duitama J, Echeverry M. (2025) Genomic characterization of Leishmania (V.) braziliensis associated with antimony therapeutic failure and variable in vitro tolerance to amphotericin B. SCIENTIFIC REPORTS (ISSN 2045-2322) 15 (1), pp. 12973-12973. - 2025
Improved Time Bounds for Exact Algorithms of the Shortest Path Tour Problem with Time Windows Tesis

2025

.(2025). Improved Time Bounds for Exact Algorithms of the Shortest Path Tour Problem with Time Windows.Trabajo Dirigido por: Duitama J, Medaglia A - 2025
Multispecies Coffea genus genomic-scale metabolic reconstruction: insights into caffeine metabolism Tesis

2025

.(2025). Multispecies Coffea genus genomic-scale metabolic reconstruction: insights into caffeine metabolism.Trabajo Dirigido por: Duitama J - 2025
New web technologies for comparative genomics Tesis

2025

.(2025). New web technologies for comparative genomics.Trabajo Dirigido por: Duitama J, Gonzalez-Garcia L - 2025
Non-destructive prediction of nitrogen, iron and zinc content in diverse common bean seeds from a genebank using near-infrared spectroscopy Artículo

2025

Duitama J. (2025) Non-destructive prediction of nitrogen, iron and zinc content in diverse common bean seeds from a genebank using near-infrared spectroscopy. Food chemistry: Molecular Sciences (ISSN 2666-5662) 11 (1), pp. 100316-100316. - 2025
Retraining and evaluation of machine learning and deep learning models for seizure classification from EEG data Artículo

2025

Carvajal-dossman J, Guio L, García-orjuela D, Guzmán-porras J, Garces K, Naranjo A, Maradei-anaya S, Duitama J. (2025) Retraining and evaluation of machine learning and deep learning models for seizure classification from EEG data. SCIENTIFIC REPORTS (ISSN 2045-2322) 15 (1), pp. 15345-15345. - 2025
Systematic Identification of Native Bacillus spp. as a Sustainable Approach to Mitigate Cadmium in Cocoa Artículo

2025

Gonzalez A, Fernández M, Meza J, Buitrago M, María José Chica, Duitama J. (2025) Systematic Identification of Native Bacillus spp. as a Sustainable Approach to Mitigate Cadmium in Cocoa. Food Frontiers (ISSN 2643-8429) 6 (1), pp. 2077-2080. - 2025
Visualización de redes metabólicas Tesis

2025

.(2025). Visualización de redes metabólicas.Trabajo Dirigido por: Duitama J - 2025
A graph clustering algorithm for detection and genotyping of structural variants from long reads Artículo

2024

Gaitan N, Duitama J. (2024) A graph clustering algorithm for detection and genotyping of structural variants from long reads. GigaScience (ISSN 2047-217X) 13 (1), pp. 1-1. - 2024

2016-20

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

2017-10

ESTADISTICA BIOLOGIA COMPUTAC.

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

FUNDAM.PROG. CIENCIAS BIOLOGIC

2017-19

DISEÑO Y ANALISIS DE ALGORI.

2017-20

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

DISEÑO Y ANALISIS DE ALGORI.

2018-10

MATEMÁTICA ESTRUCTURAL Y LÓGIC

DISEÑO Y ANALISIS DE ALGORI.

FUNDAM.PROG. CIENCIAS BIOLOGIC

2018-20

DISEÑO Y ANALISIS DE ALGORI.

ANALISIS DATOS GENOMICA POBLAC

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

2019-10

FUNDAM.PROG. CIENCIAS BIOLOGIC

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

DISEÑO Y ANALISIS DE ALGORI.

2019-20

DISEÑO Y ANALISIS DE ALGORI.

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

2020-10

FUNDAM.PROG. CIENCIAS BIOLOGIC

INTRODUCCIÓN A LA PROGRAMACIÓN

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

2020-20

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

INTRODUCCIÓN A LA PROGRAMACIÓN

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

2021-10

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

ESTADISTICA BIOLOGIA COMPUTAC.

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

2021-20

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

2022-10

PROYECTO DE GRADO

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

ESTADISTICA BIOLOGIA COMPUTAC.

ANÁLISIS DE ALGORITMOS

2022-20

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

MATEMÁTICA ESTRUCTURAL Y LÓGIC

PROYECTO DE GRADO

2023-10

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

PROYECTO DE GRADO

ESTADISTICA BIOLOGIA COMPUTAC.

2023-20

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

PROYECTO DE GRADO

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

ANÁLISIS DE ALGORITMOS

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

2024-10

PROYECTO DE GRADO

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

ESTADISTICA BIOLOGIA COMPUTAC.

2024-20

PROYECTO DE GRADO

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

2025-10

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

PROYECTO DE GRADO

ANÁLISIS DE ALGORITMOS

ESTADISTICA BIOLOGIA COMPUTAC.

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

2025-20

PROYECTO DE GRADO

DISEÑO Y ANÁLISIS DE ALGORI.

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

2026-10

ESTADISTICA BIOLOGIA COMPUTAC.

ANTEPROYECTO

DISEÑO DE ALGORITMOS

ANÁLISIS DE ALGORITMOS

PROYECTO DE GRADO

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

2026-20

FUNDAMENTOS MATEMÁTICOS COMPUT

DISEÑO DE ALGORITMOS

POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

ALGORIT.BIOLOGIA COMPUTACIONAL

PROYECTO DE GRADO