Marcela Hernández
Associate Professor

Research Group:

Contact:

      Office: ML 627

      Email:

      Extension: 2902

  • PhD. Images & Systemes, INSA, Lyon, France.
  • D.E.A. Biomedical Engineering, INSA, Lyon, France.
  • M.S. Systems and Computing Engineering, Universidad de los Andes.
  • B.S. Systems and Computing Engineering, Universidad de los Andes.
 

Interests and Research lines:

  • Medical image processing
  • Assessment of arterial stenoses in 3D magnetic resonance angiography
  • Vascular tree extraction from 3D images
  • Vascular lesions detection in computed tomography images
  • Segmentation of abdominal fat from CT Data
  • Vessel segmentation in computed tomography scans of the lung
  • Aeration quantification in CT images of subjects with Acute Respiratory Distress Syndrome

Research Group:

2011-10

TALLER DE COMPUTACIÓN VISUAL

2011-20

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

2012-10

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

2012-20

MODELADO, SIMULACION Y OPTIMIZ

PRÁCTICA PROFESIONAL COMP

2013-10

IMÁGENES Y VISION

MODELADO, SIMULACION Y OPTIMIZ

PRACTICA DAAD

PRÁCTICA PROFESIONAL COMP

2013-20

PRÁCTICA PROFESIONAL COMP

PASANTIA ESTUDIANTES EXTERNOS

PROYECTO DIRIGIDO 12CR

PROYECTO DIRIGIDO 4CR

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. II

PROYECTO DIRIGIDO 8CR

2014-10

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

2014-20

CUPI TALLER

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

2015-10

FUNDAM.PROG. CIENCIAS BIOLOGIC

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

CUPI TALLER

2015-20

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

CUPI TALLER

2016-10

FUNDAM.PROG. CIENCIAS BIOLOGIC

CUPI TALLER

IMÁGENES Y VISION

2016-20

CUPI TALLER

2017-10

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

2017-20

ALGORITMICA Y PROGR. OBJ. I

  • Airway-Tree Segmentation in Subjects with Acute Respiratory Distress Syndrome Capítulo en Memoria

    2017

    Kristína Lidayová, Gomez D, Hernandez M, Frimmel H, $author.person.nameReference, Örjan Smedby. (2017) Airway-Tree Segmentation in Subjects with Acute Respiratory Distress Syndrome. 20th Scandinavian Conference, SCIA 2017 Image Analysis (ISBN 978-3-319-59126-1) Tromsø, Noruega. - 2017

  • Changing a Generation’s Way of Thinking: Teaching Computational Thinking Through Programming Artículo

    2017

    Buitrago F, Casallas R, Hernandez M, Reyes A, Restrepo S, Danies G. (2017) Changing a Generation’s Way of Thinking: Teaching Computational Thinking Through Programming. Review of Educational Research (ISSN 0034-6543) 87 (4), pp. 834-860. - 2017

  • CupiExamenes Software

    2017

    Suarez J, Hernandez M, ROSALES E, Cortes G, Montañez C, Agudelo C, Saavedra C. CupiExamenes. Dirección Nacional de Derecho de Autor. (2017) - 2017

  • CupiTips Software

    2017

    Suarez J, Hernandez M, ROSALES E. CupiTips. Dirección Nacional de Derecho de Autor. (2017) - 2017

  • Exploración de machine learning como técnica de segmentación pulmonar en presencia de opacidades de gran tamaño Tesis

    2017

    Caldas S .Exploración de machine learning como técnica de segmentación pulmonar en presencia de opacidades de gran tamaño (2017). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2017

  • Reconstrucción del árbol bronquial en pacientes con Síndrome de Deficiencia Respiratoria Aguda Tesis

    2017

    Chaves N .Reconstrucción del árbol bronquial en pacientes con Síndrome de Deficiencia Respiratoria Aguda (2017). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2017

  • Segmentation of the aorta artery for applications such as the elasticity quantification and the calcifications volume quantification Tesis

    2017

    Hernandez S .Segmentation of the aorta artery for applications such as the elasticity quantification and the calcifications volume quantification (2017). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2017

  • A novel hybrid registration method: Application to lung segmentation in CT images of subjects with ARDS Capítulo en Memoria

    2016

    Morales A, Gomez D, Solórzano Vargas L.E., Richard J, Orkisz M, Hernandez M. (2016) A novel hybrid registration method: Application to lung segmentation in CT images of subjects with ARDS. VIII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica Bogota, Colombia. - 2016

  • A tree-matching algorithm: Application to airways in \CT\ images of subjects with the acute respiratory distress syndrome Artículo

    2016

    Morales Pinzón A, Hernandez M, Richard J, Flórez-Valencia L, Orkisz M. (2016) A tree-matching algorithm: Application to airways in \CT\ images of subjects with the acute respiratory distress syndrome . Medical Image Analysis (ISSN 1361-8415) 35 (1), pp. 101-115. - 2016

  • Airway segmentation, skeletonization, and tree matching to improve registration of 3D CT images with large opacities in the lungs Capítulo en Memoria

    2016

    Gomez D, Anna Fabijanska, Florez Valencia L, Morales A, Dávila Serrano E.E., Richard J, $author.person.nameReference, Hernandez M. (2016) Airway segmentation, skeletonization, and tree matching to improve registration of 3D CT images with large opacities in the lungs. International Conference, ICCVG 2016, Computer Vision and Graphics, International Conference, ICCVG 2016, Warsaw, Poland, September 19-21, 2016, Proceedings (ISBN 978-3-319-46418-3) Warsaw, Polonia. - 2016

  • Analysis of PHOW representations for Alzheimer disease classification on brain structural MRI Capítulo en Memoria

    2016

    Mendoza R, González Fabio A., Arbelaez P, Puentes John, Hernandez M. (2016) Analysis of PHOW representations for Alzheimer disease classification on brain structural MRI. ISBI 2016 2016 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBN 978-1-4799-2349-6) Prague, República Checa. - 2016

  • Bison Wasp: plataforma para la ejecución de flujos de trabajo científicos Tesis

    2016

    Suarez J .Bison Wasp: plataforma para la ejecución de flujos de trabajo científicos (2016). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2016

  • Diseño e implementación de un módulo de visualización e interacción WEB Tesis

    2016

    Gonzalez J .Diseño e implementación de un módulo de visualización e interacción WEB (2016). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2016

  • Empirical evaluation of general-purpose image features for pathology-oriented image retrieval of Alzheimer Disease cases Capítulo en Memoria

    2016

    Mendoza R, Puentes John, González Fabio A., Hernandez M. (2016) Empirical evaluation of general-purpose image features for pathology-oriented image retrieval of Alzheimer Disease cases. Computer Assisted Radiology and Surgery - 30th International Congress and Exhibition CARS 2016 Heidelberg, Alemania. - 2016

  • Localized visualization and quantification of pulmonary parenchyma properties in CT scans in presence of Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS) Capítulo en Memoria

    2016

    Solórzano Vargas L.E., Morales A, Richard J, Orkisz M, Hernandez M. (2016) Localized visualization and quantification of pulmonary parenchyma properties in CT scans in presence of Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS). VIII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica Bogota, Colombia. - 2016

  • Lung segmentation and airway tree matching: Application to aeration quantification in CT images of subjects with ARDS Tesis

    2016

    Morales A .Lung segmentation and airway tree matching: Application to aeration quantification in CT images of subjects with ARDS (2016). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2016

  • MÉTODO PARA LA SEGMENTACIÓN Y CUANTIFICACIÓN AUTOMÁTICA DE TEJIDOS CORPORALES PATENT

    2016

    Hernandez M. MÉTODO PARA LA SEGMENTACIÓN Y CUANTIFICACIÓN AUTOMÁTICA DE TEJIDOS CORPORALES. Universidad de los Andes, Hospital Universitario San Ignacio, Hospices Civils de Lyon. (Código 14-103.932) (2016) - 2016

  • Localized visualization, analysis and quantification of pulmonary parenchyma deformations in 3D images in presence of acute respiratory distress syndrome (ARDS) Tesis

    2015

    Solorzano L .Localized visualization, analysis and quantification of pulmonary parenchyma deformations in 3D images in presence of acute respiratory distress syndrome (ARDS) (2015). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2015

  • Machine learning applied to the diagnosis of neurodegenerative diseases based on medical images Tesis

    2015

    Montañes D .Machine learning applied to the diagnosis of neurodegenerative diseases based on medical images (2015). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2015

  • Simultaneous skeletonization and graph description of airway trees in 3D CT images Capítulo en Memoria

    2015

    Florez Valencia L, Morales A, Richard J, Hernandez M, Orkisz M. (2015) Simultaneous skeletonization and graph description of airway trees in 3D CT images. GRETSI 2015 Lyon, Francia. - 2015

  • "Lung segmentation in 3D CT Images of Induced Acute Respiratory Distress Syndrome", MICCAI NCIGT and NIH Image Guided Therapy Workshop, Boston, USA, pp. 51, 09/2014 . OTHERPUBLICATION

    2014

  • A Modular Workflow Architecture for Coronary Centerline Extraction in Computed Tomography Angiography Data Capítulo en Memoria

    2014

    Correa E, Florez Valencia L, Orkisz M, Mouton C, Dávila Serrano Eduardo E., Hernandez M. (2014) A Modular Workflow Architecture for Coronary Centerline Extraction in Computed Tomography Angiography Data. International Conference on Computer Vision and Graphics ICCVG 2014 Lecture Notes in Computer Science (ISBN 35407161) Warsaw, Polonia. - 2014

  • A Semi-Automatic Method to Extract Canal Pathways in 3D Micro-CT Images of Octocorals Artículo

    2014

    Morales A, Orkisz M, Rodriguez C, Torres J, Teillaud S, Sanchez J, Hernandez M. (2014) A Semi-Automatic Method to Extract Canal Pathways in 3D Micro-CT Images of Octocorals. PLoS ONE (ISSN 1932-6203) 9 (1), pp. e85557-e85557. - 2014

  • An Interactive Coronary Centerline Extraction Framework for CTA Image Analysis Capítulo en Memoria

    2014

    Correa E, Hernandez M, Florez Valencia L, Orkisz M. (2014) An Interactive Coronary Centerline Extraction Framework for CTA Image Analysis. VII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica - SIB (ISSN 2322-7702) Bogota, Colombia. - 2014

  • Comparing algorithms for automated vessel segmentation in computed tomography scans of the lung: the VESSEL12 study Artículo

    2014

    Rina D. Rudyanto, Sjoerd Kerkstra, Eva M. van Rikxoort, Catalin Fetita, Pierre-Yves Brillet, Christophe Lefevre, Wenzhe Xue, Xiangjun Zhu, Jianming Liang, İlkay Öksüz, Devrim Ünay, Kamuran Kadipaşaogˇlu, Raúl San José Estépar, James C. Ross, George R. Washko, Prieto J, Hernandez M, Orkisz M, Hans Meine, Markus Hüllebrand, Christina Stöcker, Fernando Lopez Mir, Valery Naranjo, Eliseo Villanueva, Marius Staring, Changyan Xiao, Berend C. Stoel, Anna Fabijanska, Erik Smistad. (2014) Comparing algorithms for automated vessel segmentation in computed tomography scans of the lung: the VESSEL12 study. Medical Image Analysis (ISSN 1361-8415) 18 (-), pp. 1217-1232. - 2014

  • Estudio comparativo de descriptores numéricos para recuperación de imágenes médicas basada en contenido Tesis

    2014

    Florez N .Estudio comparativo de descriptores numéricos para recuperación de imágenes médicas basada en contenido (2014). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2014

  • Feature selection based on empirical-risk function to detect lesions in vascular Computed Tomography images Artículo

    2014

    Zuluaga M.A., Hernandez M, Orkisz M. (2014) Feature selection based on empirical-risk function to detect lesions in vascular Computed Tomography images. IRBM - Innovation and Research in BioMedical Engineering (ISSN 1959-0318) 35 (5), pp. 244-254. - 2014

  • Lung segmentation in 3D CT Images of Induced ARDS Capítulo en Memoria

    2014

    Morales A, Orkisz M, Richard J, Guérin Claude, Hernandez M. (2014) Lung segmentation in 3D CT Images of Induced ARDS. MICCAI Workshop: NCIGT and NIH Image Guided Therapy Workshop Boston, Estados Unidos. - 2014

  • Lung segmentation in 3D CT images from induced Acute Respiratory Distress Syndrome Capítulo en Memoria

    2014

    Morales A, Orkisz M, Richard J, Hernandez M. (2014) Lung segmentation in 3D CT images from induced Acute Respiratory Distress Syndrome. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI Beijing, China. - 2014

  • Quantification of Aeration in 3D CT Images from Induced Acute Respiratory Distress Syndrome Capítulo en Memoria

    2014

    Morales A, Hernandez M, Richard J, Torres González J, Orkisz M. (2014) Quantification of Aeration in 3D CT Images from Induced Acute Respiratory Distress Syndrome. VII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica - SIB (ISSN 2322-7702) Bogota, Colombia. - 2014

  • Reliability of the nitrogen washin-washout technique to assess end-expiratory lung volume at variable PEEP and tidal volumes Artículo

    2014

    Richard J, Pouzot C, Morales A, Torres González J, Orkisz M, Neyran B, Hernandez M, Lavenne F, Guerin C. (2014) Reliability of the nitrogen washin-washout technique to assess end-expiratory lung volume at variable PEEP and tidal volumes. Intensive Care Medicine Experimental () 2 (10), pp. 1-10. - 2014

  • Segmentation of the pulmonary vascular trees in 3D CT images using variational region-growing Artículo

    2014

    Orkisz M, Hernandez M, Pérez V, Pérez C, Prieto J, Revol-muller C. (2014) Segmentation of the pulmonary vascular trees in 3D CT images using variational region-growing. IRBM - Innovation and Research in BioMedical Engineering (ISSN 1959-0318) 35 (1), pp. 11-19. - 2014

  • CreaTools: A development framework for medical image processing software ; an application to segmentation, anomaly detection and quantification for coronary arteries Capítulo en Memoria

    2013

    Mouton C, Dávila Serrano E.E., Cervenansky F, Camarasu-pop S, Correa E, Florez Valencia L, Hernandez M, Orkisz M. (2013) CreaTools: A development framework for medical image processing software ; an application to segmentation, anomaly detection and quantification for coronary arteries. European BioImage Analysis Symposium 2013 European BioImage Analysis Symposium 2013 (ISBN ---) Barcelona, España. - 2013

  • Semi-automatic Coronary Calcification Detection in Computed Tomography Images Tesis

    2013

    Correa E .Semi-automatic Coronary Calcification Detection in Computed Tomography Images (2013). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2013

  • Static Segmentation of Thoracic Structures for the Quantification of Pulmonary Aeration in 3D CT Images in presence of Acute Respiratory Distress Syndrome Tesis

    2013

    Torres J .Static Segmentation of Thoracic Structures for the Quantification of Pulmonary Aeration in 3D CT Images in presence of Acute Respiratory Distress Syndrome (2013). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2013

  • Volume Rendering Interactive Metawidget of Heart and Coronary Arteries Tesis

    2013

    Reyes J .Volume Rendering Interactive Metawidget of Heart and Coronary Arteries (2013). Trabajo Dirigido por: Hernandez M - 2013

  • A fast lesion registration to assist coronary heart disease diagnosis in CTA images Capítulo en Memoria

    2012

    Zuluaga M, Hernandez M, Dávila J, Uriza L, Orkisz M. (2012) A fast lesion registration to assist coronary heart disease diagnosis in CTA images. International Conference on Computer Vision and Graphics Computer Vision and Graphics (ISBN 978-3-642-33563-1) Warsaw, Polonia. - 2012

  • Aprendizaje de máquinas basado en bosques aleatorios para la segmentación automática de la arteria carótida en imágenes de TAC Capítulo en Memoria

    2012

    Gutiérrez F, Corredor R, Zuluaga M, Hernandez M, Orkisz M. (2012) Aprendizaje de máquinas basado en bosques aleatorios para la segmentación automática de la arteria carótida en imágenes de TAC. Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica - SIB (ISSN 2322-7702) Bogota, Colombia. - 2012

  • CAAVAT: Análisis asistido por computador del tejido adiposo visceral en imágenes TAC Capítulo en Memoria

    2012

    Mendoza R, Douek P, Uriza L, Hernandez M. (2012) CAAVAT: Análisis asistido por computador del tejido adiposo visceral en imágenes TAC. Congreso Colombiano de Radiología Cartagena, Colombia. - 2012

  • CAAVAT: Computer Assisted Analysis of Visceral Adipose Tissue on CT images Capítulo en Memoria

    2012

    Mendoza R, Uriza L, Douek P, Hernandez M. (2012) CAAVAT: Computer Assisted Analysis of Visceral Adipose Tissue on CT images. RSNA 98th Scientific Assembly and Annual Meeting Chicago, Estados Unidos. - 2012

  • Coronary artery segmentation and stenosis quantification in CT images with use of a right generalized cylinder model Capítulo en Memoria

    2012

    Florez L, Orkisz M, Corredor R, Torres J, Correa E, Mouton C, Hernandez M. (2012) Coronary artery segmentation and stenosis quantification in CT images with use of a right generalized cylinder model. MICCAI-Workshop on 3D Cardiovascular Imaging Segmentation Challenge Nice, Francia. - 2012

  • Crea Tools: a and development framework for medical image-processing software Capítulo en Memoria

    2012

    Davila-serrano E, Guigues L, Roux J, Cervenansky F, Mouton C, Camarasu-pop S, Florez L, Hernandez M, Orkisz M. (2012) Crea Tools: a and development framework for medical image-processing software. Libre Software Meeting Geneva, Suiza. - 2012

  • CreaLungs: a variational region growing method to segment pulmonary vascular trees Capítulo en Memoria

    2012

    Prieto J, Revol-muller C, Odet C, Orkisz M, Hernandez M. (2012) CreaLungs: a variational region growing method to segment pulmonary vascular trees. ISBI VESSEL12 Challenge Barcelona, España. - 2012

  • CreaTools1: applications and development framework for medical image-processing software Capítulo en Memoria

    2012

    Davila-serrano E, Guigues L, Roux J, Cervenansky F, Pop S, Florez L, Hernandez M, Orkisz M. (2012) CreaTools1: applications and development framework for medical image-processing software. ISBI Workshop on Open Source Medical Image Analysis software Barcelona, España. - 2012

  • CreaTools: a framework to develop medical image processing software. Application to simulate pipeline stent deployment in intracranial vessels with aneurysms Capítulo en Memoria

    2012

    Davila-serrano E, Guigues L, Roux J, Cervenansky F, Pop S, Riveros J, Florez L, Hernandez M, Orkisz M. (2012) CreaTools: a framework to develop medical image processing software. Application to simulate pipeline stent deployment in intracranial vessels with aneurysms. International Conference on Computer Vision and Graphics Computer Vision and Graphics (ISBN 978-3-642-33563-1) Warsaw, Polonia. - 2012

  • CreaTools: una plataforma para desarrollo de software de procesamiento de imágenes médicas. Aplicación a la segmentación de arterias coronarias y a la detección automática de lesiones en imágenes de angioTAC Artículo

    2012

    Hernandez M, Davila-serrano E, Correa E, Torres J, Corredor R, Gutiérrez F, Florez L, Mouton C, Orkisz M. (2012) CreaTools: una plataforma para desarrollo de software de procesamiento de imágenes médicas. Aplicación a la segmentación de arterias coronarias y a la detección automática de lesiones en imágenes de angioTAC. Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095) 23 (3), pp. 3521-3528. - 2012

  • Outil d'aide au diagnostic du syndrome métabolique : Segmentation automatique du tissu adipeux viscéral Capítulo en Memoria

    2012

    Mendoza R, Uriza L, Douek P, Hernandez M. (2012) Outil d'aide au diagnostic du syndrome métabolique : Segmentation automatique du tissu adipeux viscéral. Journées Francaises de Radiologie Paris, Francia. - 2012

  • Potencial y viabilidad de la adquisición con Medipix2 para la caracterización de la pared arterial y del ateroma Capítulo en Memoria

    2012

    Mendoza R, Caicedo I, Gomez B, Uriza L, Hernandez M. (2012) Potencial y viabilidad de la adquisición con Medipix2 para la caracterización de la pared arterial y del ateroma. Congreso Colombiano de Radiología Cartagena, Colombia. - 2012

  • Segmentación de lumen arterial mediante Support Vector Machines en imágenes de TAC Capítulo en Memoria

    2012

    Corredor R, Zuluaga M, Lozano F, Orkisz M, Hernandez M. (2012) Segmentación de lumen arterial mediante Support Vector Machines en imágenes de TAC. Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica - SIB (ISSN 2322-7702) Bogota, Colombia. - 2012

  • Segmentation of the pulmonary vascular tree Capítulo en Memoria

    2012

    Prieto J, Pérez C, Perez V, Revol-muller C, Odet C, Orkisz M, Hernandez M. (2012) Segmentation of the pulmonary vascular tree. CLEI 2012 Memorias XXXVIII CLEI 2012 (ISBN 978-1-4673-0792-5) Medellin, Colombia. - 2012

  • Alteraciones en el comportamiento alimentario asociados con la pérdida del grosor de la corteza cerebral en la demencia frontotemporal Artículo

    2011

    Iragorri A, Rosas L, Filizzola C, Cano C, Uriza L, Reyes P, Hernandez M, Matallana D. (2011) Alteraciones en el comportamiento alimentario asociados con la pérdida del grosor de la corteza cerebral en la demencia frontotemporal. Revista Colombiana de Psiquiatría (ISSN 0034-7450) - (-), pp. 1-37. - 2011

  • Automatic Segmentation of Pulmonary Arterial Tree in Computer Tomography Images Capítulo en Memoria

    2011

    Gutiérrez F, Ortega D, Orkisz M, Uriza L, Hernandez M. (2011) Automatic Segmentation of Pulmonary Arterial Tree in Computer Tomography Images. Sexto Congreso Colombiano de Computación Memorias del Sexto Comgreso Colombiano de Computación (ISBN 978-1-4577-0284-6) Manizales, Colombia. - 2011

  • Automatic detection of abnormal vascular cross-sections based on density level detection and support vector machines Artículo

    2011

    Zuluaga M, Magnin I, Hernandez M, Delgado E, Lozano F, Orkisz M. (2011) Automatic detection of abnormal vascular cross-sections based on density level detection and support vector machines. Computer-Assisted Radiology and Surgery (ISSN 1861-6410) 6 (2), pp. 163-174. - 2011

  • Automatic segmentation of adipose viseral tissue from CAT images, employing anatomical invariants Capítulo en Memoria

    2011

    Mendoza R, Sánchez A, Uriza L, Hernandez M. (2011) Automatic segmentation of adipose viseral tissue from CAT images, employing anatomical invariants. Sexto Congreso Colombiano de Computación Memorias del Sexto Comgreso Colombiano de Computación (ISBN 978-1-4577-0284-6) Manizales, Colombia. - 2011

  • Evaluation framework for carotid bifurcation lumen segmentation and stenosis grading Artículo

    2011

    Hameeteman K, Zuluaga M, Freiman M, Joskowicz L, Cuisenaire O, Florez L, Gulsun M, Krissian K, Mille J, Wong W, Orkisz M, Tek H, Hernandez M, Benmansour F, Chung A, Rozie S, Van M, Van L, Sosna J, Berman P, Cohen N, Douek P, Sanchez I, Aissat M, Schaap M, Metz C, Van A, Krestin G, Niessen W, Van T. (2011) Evaluation framework for carotid bifurcation lumen segmentation and stenosis grading. Medical Image Analysis (ISSN 1361-8415) 15 (4), pp. 477-488. - 2011

  • Fast Automated Detection and Interactive Analysis of Simultaneous CMEs on Stereo COR-2 Beacon Data Capítulo en Memoria

    2011

    Hernández J, De C, Hernandez M, Hernandez J. (2011) Fast Automated Detection and Interactive Analysis of Simultaneous CMEs on Stereo COR-2 Beacon Data. 6o Congreso Colombiano de Computación Computing Congress (CCC), 2011 6th Colombian (ISBN 978-1-4577-0285-3) Manizales, Colombia. - 2011

  • Fast Automated detection of CMEs fronts relevant for the Space Weather Program Capítulo en Memoria

    2011

    Hernández J, Pérez C, Hernandez M. (2011) Fast Automated detection of CMEs fronts relevant for the Space Weather Program. Sexto Congreso Colombiano de Computación Memorias del Sexto Comgreso Colombiano de Computación (ISBN 978-1-4577-0284-6) Manizales, Colombia. - 2011

  • Informe de Actividades 2010: Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación OTHERPUBLICATION

    2011

  • Learning from Only Positive and Unlabeled Data to Detect Lesions in Vascular CT Images Capítulo en Memoria

    2011

    Zuluaga M, Hush D, Delgado E, Hernandez M, Orkisz M. (2011) Learning from Only Positive and Unlabeled Data to Detect Lesions in Vascular CT Images. Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2011 (Part III) (ISBN 978-3-642-23625-9) Toronto, Canadá. - 2011

  • Mixing Distribution Pattern In a Glass Packed Bed As a Function of Hydrophobic/Hydrophilic Surface Treatment Capítulo en Memoria

    2011

    López D, Triana J, Martínez A, Hernandez M, Ortiz P. (2011) Mixing Distribution Pattern In a Glass Packed Bed As a Function of Hydrophobic/Hydrophilic Surface Treatment. AIChE 2011 Anual Meeting October 16-21 2011 AIChE Annual Meeting Conference Proceedings (ISBN 978-0-8169-1070-0) Minneapolis, Estados Unidos. - 2011

  • Adaptación del algoritmo MARACAS para la segmentación de la bifurcación de la carótida Artículo

    2010

    Zuluaga M, Orkisz M, Delgado E, Dore V, Morales A, Hernandez M. (2010) Adaptación del algoritmo MARACAS para la segmentación de la bifurcación de la carótida. Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X) 15 (3), pp. 195-210. - 2010

  • Análisis automático de imágenes aplicado a la caracterización microestructural de piezas pulvimetalúrgicas Capítulo en Memoria

    2010

    Wilches D, Rodriguez D, Ortiz P, Hernandez M. (2010) Análisis automático de imágenes aplicado a la caracterización microestructural de piezas pulvimetalúrgicas. Quinto Congreso Colombiano de Computación Memorias del Quinto Congreso Colombiano de Computación (5CCC) (ISBN 978-958-8387-40-6) Cartagena, Colombia. - 2010

  • Can the coronary artery centerline extraction in computed tomography images be improved by use of a partial volume model? Capítulo en Memoria

    2010

    Zuluaga M, Delgado E, Hernandez M, Orkisz M. (2010) Can the coronary artery centerline extraction in computed tomography images be improved by use of a partial volume model?. International Conference on Computer Vision and Graphics Computer Vision and Graphics (ISBN 0302-9743) Warsaw, Polonia. - 2010

  • Extracción semi-automática de ejes de canales de corales Capítulo en Memoria

    2010

    Morales A, Orkisz M, Teillaud S, Hernandez M, Sanchez J. (2010) Extracción semi-automática de ejes de canales de corales. VI Seminario Internacional de Procesamiento y Análisis de Imágenes Médicas Proceedings of 6th International Seminar on Medical Image Processing and Analysis (ISBN 978-958-719-614-6) Bogota, Colombia. - 2010

  • Fast method to determine CMEs properties at 1 AU and propositions for an automated detection of CME fronts Capítulo en Memoria

    2010

    Hernández J, Lugaz N, Pérez C, Hernandez M, Roussev I. (2010) Fast method to determine CMEs properties at 1 AU and propositions for an automated detection of CME fronts. 2010 American Geophysical Union (AGU) Fall Meeting San Francisco, Estados Unidos. - 2010

  • Feature Selection for SVM-based Vascular Anomaly Detection Capítulo en Memoria

    2010

    Zuluaga M, Delgado E, Hernandez M, Orkisz M. (2010) Feature Selection for SVM-based Vascular Anomaly Detection. MICCAI Workshop on Medical Computer Vision Medical Computer Vision. Recognition Techniques and Applications in Medical Imaging (ISBN 978-3-642-18420-8) Beijing, China. - 2010

  • Identificación del movimiento ocular en videos convencionales Capítulo en Memoria

    2010

    Manzur L, Vargas J, Hernandez M, Figueroa P. (2010) Identificación del movimiento ocular en videos convencionales. Quinto Congreso Colombiano de Computación Memorias del Quinto Congreso Colombiano de Computación (5CCC) (ISBN 978-958-8387-40-6) Cartagena, Colombia. - 2010

  • Inferior Maxillary Bone Tissue Classification in 3D CT Images Capítulo en Memoria

    2010

    Moreno S, Caicedo S, Strulovic T, Briceño J, Briceño F, Gomez S, Hernandez M. (2010) Inferior Maxillary Bone Tissue Classification in 3D CT Images. International Conference on Computer Vision and Graphics Computer Vision and Graphics (ISBN 0302-9743) Warsaw, Polonia. - 2010

  • Linking local to global properties in branching modular networks: gorgonian coral colonies Artículo

    2010

    Cadena N, Rey C, Hernandez M, Teillaud S, Ardila N, Sanchez J, Sanchez J. (2010) Linking local to global properties in branching modular networks: gorgonian coral colonies. Marine Biology (ISSN 0025-3162) 157 (5), pp. 1003-1010. - 2010

  • MODELO DEL ÁRBOL VASCULAR CORONARIO A PARTIR DE IMAGENES TAC 3D + T PARA CUANTIFICACIÓN DEL PORCENTAJE DE ESTENOSIS CORONARIA EN PRESENCIA DE PLACAS ALTAMENTE CALCIFICADAS Propuesta a Colciencias (o entidades afines)

    2010

    Hernandez M. MODELO DEL ÁRBOL VASCULAR CORONARIO A PARTIR DE IMAGENES TAC 3D + T PARA CUANTIFICACIÓN DEL PORCENTAJE DE ESTENOSIS CORONARIA EN PRESENCIA DE PLACAS ALTAMENTE CALCIFICADAS. Colciencias. (2010). - 2010

  • Segmentación del tejido óseo en el hueso maxilar inferior en imágenes TAC 3D Capítulo en Memoria

    2010

    Moreno S, Strulovic T, Gómez S, Briceño J, Briceño F, Hernandez M. (2010) Segmentación del tejido óseo en el hueso maxilar inferior en imágenes TAC 3D. Quinto Congreso de Computación Memorias del Quinto Congreso Colombiano de Computación (5CCC) (ISBN 978-958-8387-40-6) Cartagena, Colombia. - 2010

  • Towards vascular abnormality detection: an SVM approach Artículo

    2010

    Zuluaga M, Orkisz M, Hernandez M, Lozano F, Magnin I. (2010) Towards vascular abnormality detection: an SVM approach. INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429) 5 (Supplement 1), pp. S355-S356. - 2010

  • Adaptacioon del algoritmo MARACAS para la segmentacioon de la bifurcacioon de la arteria carotida y cuanti cacion de estenosis en imagenes TAC Capítulo en Memoria

    2009

    Zuluaga M, Orkisz M, Delgado E, Dore V, Morales A, Hernandez M. (2009) Adaptacioon del algoritmo MARACAS para la segmentacioon de la bifurcacioon de la arteria carotida y cuanti cacion de estenosis en imagenes TAC. Quinto Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica y V Seminario Internacional de Procesamiento y Análisis de Imágenes Médicas Memorias del QUINTO SEMINARIO INTERNACIONAL DE INGENIERIA BIOMEDICA Y V SEMINARIO INTERNACIONAL DE PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE IMÁGENES MEDICAS (ISBN 978-958-695-478-5) Bogota, Colombia. - 2009

  • Adaptación del algoritmo MARACAS para la segmentación de la bifurcación de la arteria carótida y cuantificación de estenosis en imágenes TAC Capítulo en Memoria

    2009

    Zuluaga M, Orkisz M, Delgado E, Dore V, Morales A, Hernandez M. (2009) Adaptación del algoritmo MARACAS para la segmentación de la bifurcación de la arteria carótida y cuantificación de estenosis en imágenes TAC. QUINTO SEMINARIO INTERNACIONAL DE INGENIERIA BIOMEDICA Y V SEMINARIO INTERNACIONAL DE PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE IMÁGENES MEDICAS Memorias del QUINTO SEMINARIO INTERNACIONAL DE INGENIERIA BIOMEDICA Y V SEMINARIO INTERNACIONAL DE PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE IMÁGENES MEDICAS (ISBN 978-958-695-478-5) Bogota, Colombia. - 2009

  • Adaptations of MARACAS algorithm to the segmentation of the carotid bifurcation and stenosis quantification in CTA images Capítulo en Memoria

    2009

    Zuluaga M, Orkisz M, Delgado E, Dore V, Morales A, Hernandez M. (2009) Adaptations of MARACAS algorithm to the segmentation of the carotid bifurcation and stenosis quantification in CTA images. Midas Journal: MICCAI Workshop - 3D Segmentation in the Clinic: A Grand Challenge III Midas Journal (ISSN 2327-770X) Wimbledon, Reino Unido. - 2009

  • Evaluación del efecto de volumen parcial en imágenes TAC para el mejoramiento de la segmentación arterial coronaria Capítulo en Memoria

    2009

    Zuluaga M, Hernandez M, Orkisz M. (2009) Evaluación del efecto de volumen parcial en imágenes TAC para el mejoramiento de la segmentación arterial coronaria. QUINTO SEMINARIO INTERNACIONAL DE INGENIERIA BIOMEDICA Y V SEMINARIO INTERNACIONAL DE PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE IMÁGENES MEDICAS Memorias del QUINTO SEMINARIO INTERNACIONAL DE INGENIERIA BIOMEDICA Y V SEMINARIO INTERNACIONAL DE PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE IMÁGENES MEDICAS (ISBN 978-958-695-478-5) Bogota, Colombia. - 2009

  • Evaluation of partial volume effects in computer tomography for the improvement of coronary artery segmentation Artículo

    2009

    Zuluaga M, Orkisz M, Hernandez M. (2009) Evaluation of partial volume effects in computer tomography for the improvement of coronary artery segmentation. INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429) 4 (Supplement 1), pp. s41-s41. - 2009

  • Medición automática de la tasa de calcificación de corales en imágenes de microscopía confocal Capítulo en Memoria

    2009

    Morales A, Teillaud S, Gómez C, Hernandez M, Sanchez J. (2009) Medición automática de la tasa de calcificación de corales en imágenes de microscopía confocal. Abstract book of the Latin American Informatics Conference XXXV Conferencia Latinoamericana de Informática - CLEI 2009 (ISBN 857669247-3) Pelotas, Brasil. - 2009

  • Mejoramiento de la segmentación arterial coronaria a través del modelamiento del volumen parcial en imágenes de TAC Artículo

    2009

    Zuluaga M, Orkisz M, Hernandez M. (2009) Mejoramiento de la segmentación arterial coronaria a través del modelamiento del volumen parcial en imágenes de TAC. Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095) 20 (3), pp. 2702-2707. - 2009

  • Segmentación del tejido óseo en el maxilar inferior para el estudio de la regeneración ósea Capítulo en Memoria

    2009

    Moreno S, Gomez S, Briceño J, Strulovic T, Pereira C, Hernandez M. (2009) Segmentación del tejido óseo en el maxilar inferior para el estudio de la regeneración ósea. Quinto Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica y V Seminario Internacional de Procesamiento y Análisis de Imágenes Médicas Memorias del QUINTO SEMINARIO INTERNACIONAL DE INGENIERIA BIOMEDICA Y V SEMINARIO INTERNACIONAL DE PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE IMÁGENES MEDICAS (ISBN 978-958-695-478-5) Bogota, Colombia. - 2009

  • Standardized evaluation methodology and reference database for evaluating coronary artery centerline extraction algorithms Artículo

    2009

    Schaap M, Metz C, Van T, Van A, Weustink A, Mollet N, Bauer C, Bogunovic H, Castro C, Deng X, Dikici E, O’donnell T, Frenay M, Friman O, Hernandez M, Kitslaar P, Krissian K, Kuehnel C, Luengo M, Orkisz M, Smedby O, Styner M, Szymczak A, Tek H, Wang C, Warfield S, Zambal S, Zhang Y, Krestin G, Niessen W. (2009) Standardized evaluation methodology and reference database for evaluating coronary artery centerline extraction algorithms. Medical Image Analysis (ISSN 1361-8415) 13 (5), pp. 701-714. - 2009

  • Coronary centerline tracking in CT images with use of an elastic model and image moments Capítulo en Memoria

    2008

    Hernandez M, Zuluaga M, Lozano M, Prieto J, Douek P, Magnin I, Orkisz M. (2008) Coronary centerline tracking in CT images with use of an elastic model and image moments. Midas Journal: IJ - MICCAI Workshop - Grand Challenge Coronary Artery Tracking Midas Journal (ISSN 2327-770X) New York, Estados Unidos. - 2008

  • Cortical Thickness Measurement from Magnetic Resonance Images Using Partial Volume Estimation Capítulo en Memoria

    2008

    Zuluaga M, Oscar, Pierrick, Hernandez M, Olivier, Sébastien. (2008) Cortical Thickness Measurement from Magnetic Resonance Images Using Partial Volume Estimation. SPIE: Medical Imaging Proceedings of SPIE (ISBN 0277-786X) San Diego, Estados Unidos. - 2008

  • Estudio no destructivo de los canales internos de octocorales por medio del análisis de imágenes biológicas y médicas Capítulo en Memoria

    2008

    Nestor, Hernandez M, Stanislas, Maciej, Eduardo, Olivier, Jerôme, Lozano F, Camilo, Sanchez J. (2008) Estudio no destructivo de los canales internos de octocorales por medio del análisis de imágenes biológicas y médicas. XIII Seminario Nacional de Ciencia y Tecnología del Mar. XIII Seminario Nacional de Ciencia y Tecnología del Mar (ISBN 9789589863404) Colombia. - 2008

  • Medición del espesor de la membrana basal capilar glomerular (MBCG) en microfotografías electrónicas digitales Capítulo en Memoria

    2008

    Hernandez M, Marcela. (2008) Medición del espesor de la membrana basal capilar glomerular (MBCG) en microfotografías electrónicas digitales. III Congreso de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica III Congreso de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica (ISBN 98-01107-77-4) Pereira, Colombia. - 2008

  • Models, algorithms and applications in vascular image segmentation Artículo

    2008

    Orkisz M, Florez L, Hernandez M. (2008) Models, algorithms and applications in vascular image segmentation. Machine Graphics and Vision (ISSN 1230-0535) 17 (1), pp. 3-33. - 2008

  • Segmentación de la membrana basal capilar glomerular en imágenes digitales para el cálculo del espesor medio Capítulo en Memoria

    2008

    Ochoa B, Hernandez M. (2008) Segmentación de la membrana basal capilar glomerular en imágenes digitales para el cálculo del espesor medio. XXXIV Conferencia Latinoamericana de Informática (CLEI 2008) XXXIV Conferencia Latinoamericana de Informática (ISBN 978-950-9770-02-7) Argentina. - 2008

  • Carotid artery segmentation and characterization in 3D computed tomography (CT) images Artículo

    2007

    Zuluaga M, Dávila E, Uriza L, Hernandez M. (2007) Carotid artery segmentation and characterization in 3D computed tomography (CT) images. INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429) 2 (1), pp. S72-S74. - 2007

  • Carotid stenosis disease: use of mathematical and computational analysis as a diagnostic aid Artículo

    2007

    Fernández I, Angeles M, Zuluaga M, Uriza L, Hernandez M, Briceño J. (2007) Carotid stenosis disease: use of mathematical and computational analysis as a diagnostic aid. ASAIO Journal (ISSN 1058-2916) 53 (2), pp. 52A-52A. - 2007

  • Fast marching contours for the segmentation of vessel lumen in CTA cross-sections Capítulo en Memoria

    2007

    Baltaxe M, Florez L, Hernandez M, Magnin I, Orkisz M. (2007) Fast marching contours for the segmentation of vessel lumen in CTA cross-sections. IEEE EMBS Annual International Conference Proceedings Of The 29th Annual International Conference Of The Ieee Engineering In Medicine And Biology Society (ISBN 1424407885) Francia. - 2007

  • Fast marching level-sets for the extraction of vascular cross-sectional contours in CT angiography images Artículo

    2007

    Florez L, Baltaxe M, Hernandez M, Vincent F, Doeuk P, Orkisz M. (2007) Fast marching level-sets for the extraction of vascular cross-sectional contours in CT angiography images. Computer-Assisted Radiology and Surgery (ISSN 1861-6410) 2 (1), pp. S449-S450. - 2007

  • Generación de modelos arteriales tridimensionales a partir de imágenes de resonancia magnética (IRM) Artículo

    2007

    Cantor D, Orkisz M, Uriza L, Hernandez M. (2007) Generación de modelos arteriales tridimensionales a partir de imágenes de resonancia magnética (IRM). Libro de Resúmenes Del Xxix Congreso Colombiano de Radiología (ISSN 1909-5112) 2 (1), pp. 13-13. - 2007

  • Modelamiento en 3D de patologías vasculares a partir de imágenes de resonancia magnética sustraída Artículo

    2007

    Cantor D, Arias J, Uriza L, Hernandez M. (2007) Modelamiento en 3D de patologías vasculares a partir de imágenes de resonancia magnética sustraída. Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095) 18 (4), pp. 2225 - 2232. - 2007

  • Procesamiento de imágenes y diagnóstico médico: experiencia Uniandes- Hospital San Ignacio Capítulo en Memoria

    2007

    Hernandez M, Uriza L. (2007) Procesamiento de imágenes y diagnóstico médico: experiencia Uniandes- Hospital San Ignacio. Cuarto Seminario de Ingenierìa Biomédica Bogota, Colombia. - 2007

  • Recursive tracking of vascular tree axes in 3D medical images Artículo

    2007

    Carrillo J, Hernandez M, Dávila E, Orkisz M. (2007) Recursive tracking of vascular tree axes in 3D medical images. INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429) 1 (6), pp. 331-339. - 2007

  • Activación plaquetaria en presencia de estenosis carotídea: modelo computacional y experimental Artículo

    2006

    Angeles M, Hernandez M, Uriza L, Briceño J. (2006) Activación plaquetaria en presencia de estenosis carotídea: modelo computacional y experimental. Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095) 17 (3), pp. 1868-1877. - 2006

  • Automatic vascular tree segmentation Capítulo en Memoria

    2006

    Carrillo J, Hernandez M, Orkisz M. (2006) Automatic vascular tree segmentation. XXXII Conferencia Latinoamericana de Informática Actas de la XXXII Conferencia Latinoamericana de Informatica (CD ROM) (ISBN 95630302) Santiago, Chile. - 2006

  • Dinámica cardiovascular: Estenosis carotídea Capítulo en Memoria

    2006

    Zuluaga M, Sergio, Luis, Hernandez M. (2006) Dinámica cardiovascular: Estenosis carotídea. XVIII Congreso de la Sociedad Ibero Latinoamericana de Neuroradiología Zaragoza, España. - 2006

  • Evaluación de riesgo asociado a activación plaquetaria en presencia de estenosis carotídea: modelo computacional y experimental Artículo

    2006

    Angeles M, Arias J, Uriza L, Hernandez M, Briceño J. (2006) Evaluación de riesgo asociado a activación plaquetaria en presencia de estenosis carotídea: modelo computacional y experimental. Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095) 17 (3), pp. 1972-1981. - 2006

  • Evaluation of semi-automatic arterial stenosis quantification Artículo

    2006

    Hernandez M, Serfaty J, Maghiar A, Mansard C, Orkisz M, Magnin I, Douek P. (2006) Evaluation of semi-automatic arterial stenosis quantification. INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429) 1 (3), pp. 167-175. - 2006

  • Hemodynamics of carotid stenosis: a diagnostic image characterization and computational study Artículo

    2006

    Arias J, Zuluaga M, Hernandez M, Briceño J. (2006) Hemodynamics of carotid stenosis: a diagnostic image characterization and computational study. ASAIO Journal (ISSN 1058-2916) 52 (2), pp. 57A-57A. - 2006

  • Segmentación de arteriolas en la microcirculación de hemosustitutos para la medición de la variación en el tiempo de su diámetro mediante el procesamiento de imágenes Capítulo en Memoria

    2006

    Cancino S, Pastrana F, Briceño J, Hernandez M. (2006) Segmentación de arteriolas en la microcirculación de hemosustitutos para la medición de la variación en el tiempo de su diámetro mediante el procesamiento de imágenes. XXXII Conferencia Latinoamericana de Informática Actas de la XXXII Conferencia Latinoamericana de Informatica (CD ROM) (ISBN 95630302) Santiago, Chile. - 2006

  • Segmentación y visualización arterial en ARM y TAC 3D Artículo

    2006

    Carrillo J, Hernandez M, Dávila E, Orkisz M. (2006) Segmentación y visualización arterial en ARM y TAC 3D. Libro de Resúmenes Del Xxix Congreso Colombiano de Radiología (ISSN 1909-5112) 1 (1), pp. 21-22. - 2006

  • Segmentación y visualización arterial en arm y tc Artículo

    2006

    Carrillo J, Hernandez M, Dávila E, Orkisz M. (2006) Segmentación y visualización arterial en arm y tc. Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095) 17 (4), pp. 2028 - 2036. - 2006

  • Vascular centerline extraction in 3D MR angiograms for phase contrast MRI blood flow measurement Artículo

    2006

    Hernandez M, Or?owski P, Piatkowska E, Bogorodzki P, Orkisz M. (2006) Vascular centerline extraction in 3D MR angiograms for phase contrast MRI blood flow measurement. Computer-Assisted Radiology and Surgery (ISSN 1861-6410) 1 (1), pp. 51-61. - 2006

  • Vascular tree extraction from 3D images Artículo

    2006

    Carrillo J, Hernandez M, Dávila E, Orkisz M. (2006) Vascular tree extraction from 3D images. Computer-Assisted Radiology and Surgery (ISSN 1861-6410) 1 (1), pp. 462-462. - 2006

  • Assessment of carotid artery stenoses in 3D contrast-enhanced magnetic resonance angiography, based on improved generation of the centerline Artículo

    2005

    Hernandez M, Orkisz M, Douek P, Magnin I. (2005) Assessment of carotid artery stenoses in 3D contrast-enhanced magnetic resonance angiography, based on improved generation of the centerline. Machine Graphics and Vision (ISSN 1230-0535) 14 (4), pp. 349-378. - 2005

  • Desarrollo de una metodología semiautomática para la detección de los contornos de la pared de la arteria carótida en imágenes ultrasónicas en modo M Capítulo en Memoria

    2005

    Lamus C, Uriza L, Hernandez M. (2005) Desarrollo de una metodología semiautomática para la detección de los contornos de la pared de la arteria carótida en imágenes ultrasónicas en modo M. II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica Memorias del II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica (ISBN 95833840) Bogota, Colombia. - 2005

  • Efecto del grado de estenosis y la viscosidad en el nivel de activación plaquetaria a través de una estenosis de la arteria carótida: Desarrollo de un modelo computacional 2D Capítulo en Memoria

    2005

    Arias J, Angeles M, Hernandez M, Uriza L, Briceño J. (2005) Efecto del grado de estenosis y la viscosidad en el nivel de activación plaquetaria a través de una estenosis de la arteria carótida: Desarrollo de un modelo computacional 2D. II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica Memorias del II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica (ISBN 95833840) Bogota, Colombia. - 2005

  • Efecto del grado de estenosis y la viscosidad sanguínea en el nivel de activación plaquetaría en la arteria carótida: Desarrollo de un modelo computacional Artículo

    2005

    Arias J, Angeles M, Uriza L, Hernandez M, Briceño J. (2005) Efecto del grado de estenosis y la viscosidad sanguínea en el nivel de activación plaquetaría en la arteria carótida: Desarrollo de un modelo computacional. Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095) 16 (1), pp. 1671-1680. - 2005

  • Effect of stenosis severity and blood viscosity on platelet activation index: a computational study on a 2D carotid bifurcation Capítulo en Memoria

    2005

    Arias J, Hernandez M, Uriza L, Briceño J, Nieto E. (2005) Effect of stenosis severity and blood viscosity on platelet activation index: a computational study on a 2D carotid bifurcation. Summer Bioengineering Conference Effect Of Stenosis Severity And Blood Viscosity On Platelet Activation Index: A Computational Study On A 2d Carotid Bifurcation (ISBN 0791837610) Colorado City, Estados Unidos. - 2005

  • Estado del arte tecnológico, necesidades y prioridades en las áreas de procesamiento de imágenes diagnósticas, telemedicina y sistemas de información hospitalaria Capítulo en Memoria

    2005

    Cancino S, Uriza L, Hernandez M. (2005) Estado del arte tecnológico, necesidades y prioridades en las áreas de procesamiento de imágenes diagnósticas, telemedicina y sistemas de información hospitalaria. Congreso Colombiano de Radiología Cartagena, Colombia. - 2005

  • Extraction of 3D vascular tree skeletons based on the analysis of connected components evolution Capítulo en Memoria

    2005

    Carrillo J, Orkisz M, Hernandez M. (2005) Extraction of 3D vascular tree skeletons based on the analysis of connected components evolution. 11th Int. IAPR Conf. Computer Analysis of Images and Patterns (CAIP 2005) Computer Analysis of Images and Patterns (ISBN 978-3-540-28969-2) Versailles, Francia. - 2005

  • Image Processing in Contrast-Enhanced MR Angiography Capítulo de libro

    2005

    Douek P, Hernandez M, Orkisz M. (2005) Image Processing in Contrast-Enhanced MR Angiography. Magnetic Resonance Angiography (ISBN 978-88-470-0266-1) pp. 55-64. Springer - 2005

  • Ingeniería Biomédica. Los rastros del camino. Artículo

    2005

    Briceño J, Salazar A, Hernandez M, Amaya L, Cavelier G, Cabrales P. (2005) Ingeniería Biomédica. Los rastros del camino.. Revista De Ingeniería (ISSN 0121-4993) 22 (22), pp. 164-168. - 2005

  • Medición del diámetro de un vaso sanguíneo en la microcirculación con hemosustitutos Capítulo en Memoria

    2005

    Cancino S, Piedrahita G, Hernandez M. (2005) Medición del diámetro de un vaso sanguíneo en la microcirculación con hemosustitutos. II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica Memorias del II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica (ISBN 95833840) Bogota, Colombia. - 2005

  • Optimisation de la sélection du plan d acquisition pour la mesure du flux sanguin par l IRM de contraste de phase, utilisant l extraction de l axe vasculaire dans les images d angiographie par résonance magnétique 3D Capítulo en Memoria

    2005

    Hernandez M, Orlowsky P, Piatkowska E, Bogorodzki P, Orkisz M. (2005) Optimisation de la sélection du plan d acquisition pour la mesure du flux sanguin par l IRM de contraste de phase, utilisant l extraction de l axe vasculaire dans les images d angiographie par résonance magnétique 3D. Forum Recherche en GBM Nancy, Francia. - 2005

  • Optimisation de la sélection du plan d¿acquisition pour la mesure du flux sanguin par l¿IRM de contraste de phase, utilisant l¿extraction de l¿axe vasculaire dans les images d¿angiographie par résonance magnétique 3D Capítulo en Memoria

    2005

    Hernandez M, Orkisz M, Orlowsky P, Janko E, Bogorodzki P. (2005) Optimisation de la sélection du plan d¿acquisition pour la mesure du flux sanguin par l¿IRM de contraste de phase, utilisant l¿extraction de l¿axe vasculaire dans les images d¿angiographie par résonance magnétique 3D. Forum Recherche en GBM Computing in Cardiology (ISBN 978-1-4244-2533-4) Francia. - 2005

  • Segmentación vascular y caracterización de placas ateroscleróticas en imágenes de tomografía computarizada 3D Capítulo en Memoria

    2005

    Zuluaga M, Iván S, Felipe L, Hernandez M. (2005) Segmentación vascular y caracterización de placas ateroscleróticas en imágenes de tomografía computarizada 3D. XXXI Conferencia Latinoamericana de Informática Segmentación Vascular Y Caracterización De Placas Ateroscleróticas En Imágenes De Tomografía Computarizada 3d (ISBN 958670422X) Chile. - 2005

  • Segmentación y caracterización de la arteria carótida enescanografías 3D Artículo

    2005

    Zuluaga M, Mesa S, Uriza L, Hernandez M. (2005) Segmentación y caracterización de la arteria carótida enescanografías 3D. Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095) 16 (3), pp. 1768-1778. - 2005

  • Sistema interactivo de segmentación de imágenes tridimensionales del hígado humano Capítulo en Memoria

    2005

    Mesa S, Hernandez J, Uriza L, Hernandez M. (2005) Sistema interactivo de segmentación de imágenes tridimensionales del hígado humano. II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica Memorias del II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica (ISBN 95833840) Bogota, Colombia. - 2005

  • Vascular centerline extraction in 3D MR angiograms to optimize acquisition plane for blood flow measurement by phase contrast MRI Capítulo en Memoria

    2005

    Hernandez M, Orlowsky P, Piatkowska E, Bogorodzki P, Orkisz M. (2005) Vascular centerline extraction in 3D MR angiograms to optimize acquisition plane for blood flow measurement by phase contrast MRI. Computer Assisted Radiology and Surgery Proceedings of the 19th International Congress and Exhibition (ISBN 0-444-51872-X) Berlin, Alemania. - 2005

  • Desarrollo de un modelo computacional para estudio de la enfermedad arteriosclerótica carotídea Capítulo en Memoria

    2004

    Uriza L, Arias J, Nieto E, Hernandez M, Briceño J. (2004) Desarrollo de un modelo computacional para estudio de la enfermedad arteriosclerótica carotídea. XXIX Congreso Colombiano de Radiología Cartagena, Colombia. - 2004

  • Detección semiautomática de contornos en imágenes de ecocardiografía modo M Artículo

    2004

    Lamus C, Nieto E, Hernandez M. (2004) Detección semiautomática de contornos en imágenes de ecocardiografía modo M. Revista De Ingeniería (ISSN 0121-4993) 20 (20), pp. 42-49. - 2004

  • Estudio de la hemodinámica a través de una estenosis de la bifurcación de la arteria carótida y su influencia en las observaciones clínicas:  Protocolo de adquisición de imágenes y simulación Capítulo en Memoria

    2004

    Arias J, Caicedo V, Nieto E, Hernandez M, Uriza L, Briceño J. (2004) Estudio de la hemodinámica a través de una estenosis de la bifurcación de la arteria carótida y su influencia en las observaciones clínicas:  Protocolo de adquisición de imágenes y simulación. II Congreso internacional de la regiòn andina IEEE (Andescon) Ii Congreso Internacional De La Region Andina, Ieee Colombia, Andescon2004 (ISBN 9583365343) Bogota, Colombia. - 2004

  • Relación ingeniería, biología y medicina: lineamientos generales en este campo para la actividad académica de la Facultad de Ingeniería de la Universidad de los Andes Artículo

    2004

    Hernandez M, Briceño J, Em N, Salazar A, Torres J, Hernandez J, Tabima D. (2004) Relación ingeniería, biología y medicina: lineamientos generales en este campo para la actividad académica de la Facultad de Ingeniería de la Universidad de los Andes. Revista De Ingeniería (ISSN 0121-4993) 20 (20), pp. 70-75. - 2004

  • Automated generation of vessel centerlines and volumetric assessment of stenoses from MRA images Capítulo en Memoria

    2002

    Hernandez M, Orkisz M, Magnin I, Douek P. (2002) Automated generation of vessel centerlines and volumetric assessment of stenoses from MRA images. XIII Int. Workshop on MRA Computing in Cardiology (ISBN 978-1-4244-2533-4) Essen, Alemania. - 2002

  • Computer Assisted Analysis of 3D MRA Images Artículo

    2002

    Hernandez M, Orkisz M, Puech P, Mansard C, Douek P, Magnin I. (2002) Computer Assisted Analysis of 3D MRA Images. Radiographics : a review publication of the Radiological Society of North America, Inc (ISSN 0271-5333) 22 (2), pp. 421-436. - 2002

  • Développement récent dans le traitement d'images : principes des techniques de segmentation Capítulo de libro

    2002

    Orkisz M, Hernandez M. (2002) Développement récent dans le traitement d'images : principes des techniques de segmentation. Angiographie par Résonance Magnétique (ISBN 2294003438) pp. 62-73. Masson - 2002

  • From inertia matrix to the analysis of vascular pathologies Capítulo en Memoria

    2002

    Orkisz M, Hernandez M. (2002) From inertia matrix to the analysis of vascular pathologies. Int. Conf. Computer Vision and Graphics Proc. of Int. Conf. Computer Vision and Graphics (ISBN 8391768309) Polonia. - 2002

  • PhD Thesis: Segmentation anisotrope pour la quantification en imagerie vasculaire par résonnance magnétique OTHERPUBLICATION

    2002

  • Podstawy technik segmentacji stosowanych w przetwarzaniu obrazów 3D naczyn krwionosnych Capítulo de libro

    2002

    Orkisz M, Hernandez M. (2002) Podstawy technik segmentacji stosowanych w przetwarzaniu obrazów 3D naczyn krwionosnych. Polska Akademia Nauk. Biocybernetyka i Inzynieria Biomedyczna (ISBN 838767463X) pp. 351-370. Akademicka Oficyna Wydawnicza EXIT - 2002

  • Quantification de la sténose artérielle dans des images ARM 3D fondée sur l'extraction automatique de l'axe central du vaisseau Artículo

    2002

    Hernandez M, Orkisz M, Magnin I, Douek P. (2002) Quantification de la sténose artérielle dans des images ARM 3D fondée sur l'extraction automatique de l'axe central du vaisseau. Journal de Radiologie (ISSN 0221-0363) 83 (10), pp. 1423-1423. - 2002

  • Standardized MR protocol for the evaluation of MRA sequences and/or contrast agents effects in high-degree arterial stenosis analysis. Artículo

    2002

    Marchand B, Douek P, Robert P, Corot C, Roux J, Adeleine P, Hernandez M, Crémillieux Y, Orkisz M, Canet E. (2002) Standardized MR protocol for the evaluation of MRA sequences and/or contrast agents effects in high-degree arterial stenosis analysis.. Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology, and Medicine (ISSN 0968-5243) 14 (3), pp. 259-267. - 2002

  • Advances in image processing techniques applied to 3D MRA images enhancement, segmentation and quantification - A survey and contributions. Artículo

    2001

    Orkisz M, Hernandez M, Douek P, Magnin I. (2001) Advances in image processing techniques applied to 3D MRA images enhancement, segmentation and quantification - A survey and contributions.. Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology, and Medicine (ISSN 0968-5243) 12 (1), pp. 44-44. - 2001

  • Automatic image segmentation and stenosis quantification applied to MRA and to high resolution MR images Capítulo en Memoria

    2001

    Mansard C, Hernandez M, Orkisz M, Puech P, Chaabane L, Serfaty J, Magnin I, Douek P. (2001) Automatic image segmentation and stenosis quantification applied to MRA and to high resolution MR images. 2nd Int. Workshop on Coronary MR and CT Angiography Computing in Cardiology (ISBN 978-1-4244-2533-4) Chicago, Estados Unidos. - 2001

  • Maracas (MAgnetic Resonance Angiography Computer ASsisted Analysis): An Interactive Software for Visualization and Analysis of Blood Vessels in 3D MRA Providing Automatic Quantification of the Arterial Stenosis Artículo

    2001

    Hernandez M, Orkisz M, Mansard C, Anwander A, Neyran B, Roux J, Boix E, Magnin I, Douek P. (2001) Maracas (MAgnetic Resonance Angiography Computer ASsisted Analysis): An Interactive Software for Visualization and Analysis of Blood Vessels in 3D MRA Providing Automatic Quantification of the Arterial Stenosis. Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology, and Medicine (ISSN 0968-5243) 12 (1), pp. 47-47. - 2001

  • Models for 3D vascular image analysis Artículo

    2001

    Orkisz M, Hernandez M. (2001) Models for 3D vascular image analysis. Journal of Medical Informatics and Technologies (ISSN 1642-6037) 2 (1), pp. IP13-IP22. - 2001

  • Value of MRA Sequences and Contrast Agents For the Evaluation of High-Degree Stenosis: A Phantom Study. Capítulo en Memoria

    2001

    Marchand B, Douek P, Corot C, Roux J, Adeleine P, Hernandez M, Orkisz M, Crémillieux Y, Canet E. (2001) Value of MRA Sequences and Contrast Agents For the Evaluation of High-Degree Stenosis: A Phantom Study.. 9th ISMRM (International Society for Magnetic Resonance in Medicine) Annual Meeting Computing in Cardiology (ISBN 978-1-4244-2533-4) Glasgow, Gran Bretaña. - 2001

  • A deformable vessel model with single point initialization for segmentation, quantification and visualization of blood vessels in 3D MRA Capítulo en Memoria

    2000

    Hernandez M, Anwander A, Orkisz M, Roux J, Douek P, Magnin I. (2000) A deformable vessel model with single point initialization for segmentation, quantification and visualization of blood vessels in 3D MRA. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2000 Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2000n – MICCAI 2000 Third International Conference (ISBN 3-540-41189-5) Pittsburgh, Estados Unidos. - 2000

  • Advances of blood vessel morphology analysis in 3D magnetic resonance images Artículo

    2000

    Orkisz M, Hernandez M, Douek P, Magnin I. (2000) Advances of blood vessel morphology analysis in 3D magnetic resonance images. Machine Graphics and Vision (ISSN 1230-0535) 9 (1/2), pp. 463-471. - 2000

  • Diagnostic des Sténoses de l'Artère Rénale en Angiographie par Résonance Magnétique et Appréciation du Degré de Sténose. Artículo

    2000

    Marchand B, Hernandez M, Orkisz M, Douek P. (2000) Diagnostic des Sténoses de l'Artère Rénale en Angiographie par Résonance Magnétique et Appréciation du Degré de Sténose.. Journal des Maladies Vasculaires (ISSN 0398-0499) 25 (5), pp. 312-320. - 2000

  • Maracas (MAgnetic Resonance Angiography Computer ASsisted analysis): Logiciel de visualisation et de traitement d'images ARM 3D Artículo

    2000

    Hernandez M, Orkisz M, Pierre J, Magnin I, C P. (2000) Maracas (MAgnetic Resonance Angiography Computer ASsisted analysis): Logiciel de visualisation et de traitement d'images ARM 3D. Journal de Radiologie (ISSN 0221-0363) 81 (10), pp. 1524-1524. - 2000

  • Automatic Vessel Axis Extraction and Equivalent Diameter Estimation from 3D MRA Data Artículo

    1999

    Orkisz M, Hernandez M, Douek P. (1999) Automatic Vessel Axis Extraction and Equivalent Diameter Estimation from 3D MRA Data. Acta Radiologica (ISSN 0284-1851) 41 (422), pp. 63-63. - 1999

  • Inertia-based vessel axis extraction and stenosis quantification in 3D MRA images Capítulo en Memoria

    1999

    Hernandez M, Orkisz M, Pierre J, C P. (1999) Inertia-based vessel axis extraction and stenosis quantification in 3D MRA images. CARS'99 Cars'99-Computer Assisted Radiology And Surgery (ISBN 0444502904) Francia. - 1999

  • Développements récents dans le traitement d'images : principes des techniques de segmentation d'images vasculaires 3D Capítulo en Memoria

    1998

    Orkisz M, Hernandez M. (1998) Développements récents dans le traitement d'images : principes des techniques de segmentation d'images vasculaires 3D. 2-èmes Journées du Groupe de Recherche et de Réflexion en Angiographie par Résonance Magnétique Computing in Cardiology (ISBN 978-1-4244-2533-4) Orsay, Francia. - 1998

  • ORCA: Modelo de un Sistema de Soporte a Procesos de Negociación en Grupo Capítulo en Memoria

    1996

    Hernandez M, Quintero A. (1996) ORCA: Modelo de un Sistema de Soporte a Procesos de Negociación en Grupo. XXII Conferencia Latino-Americana de Informatica Computing in Cardiology (ISBN 978-1-4244-2533-4) Bogota, Colombia. - 1996

  • GENES: Sistema Experto en el Diagnostico de Errores Innatos del Metabolismo Capítulo en Memoria

    1994

    Hernandez M, Alejandro L. (1994) GENES: Sistema Experto en el Diagnostico de Errores Innatos del Metabolismo. III Congrès Latino-Américain de Genétique Computing in Cardiology (ISBN 978-1-4244-2533-4) Ciudad de México, México. - 1994

  • Hacia la Ingenieria de Software Cooperativo Capítulo en Memoria

    1994

    Hernandez M, Rodriguez M. (1994) Hacia la Ingenieria de Software Cooperativo. XIV Jornadas de Informatica Computing in Cardiology (ISBN 978-1-4244-2533-4) Bogota, Colombia. - 1994

 

Education

Degree Discipline Institution Year
Ph.D Biomedical Engineering INSA de Lyon 2002
M.Sc Biomedical Engineering INSA de Lyon 1998
M.Sc Systems and Computing Engineering Universidad de los Andes 1996
B.Sc Systems and Computing Engineering Universidad de los Andes 1993

 

Academic experience

Institution Rank Tittle (chair, coordinator, etc.) When

(ex. 1995-1997)

Full time or part-time
Universidad de los Andes Associate Professor Academic coordinator of the SCE Dept. 2010-Present FT
Universidad de los Andes Associate Professor Chair of the MSc in SCE 2009-2010 FT
Universidad de los Andes Assistant Professor 2004-2008 FT

 

Non-academic experience

 

Certifications or professional registrations

Colombia, Professional Card

 

Current membership in professional organizations

 

Honors and awards

  1. First prix Siemens – InforMag to the MARACAS software in the “Journées Françaises de Radiologie 2000”. Paris.
  2. Outstanding Professor. School of Engineering. Universidad de Los Andes. 1997.

 

Service activities (within and outside of the institutions) 

  1. Contribution to the administration work of the Department of Systems and Computing Engineering, including its councils and committees.
  2. Assessment of the need for and appropriateness of new and revised MSc programs.
  3. Responsible for providing information required to keep research and academic records accurate and up-to-date.
  4. In charge of relationship between the Department of Systems and Computing Engineering and foreign universities for developing academic collaborations.

 

List of the most important publications and presentations from the past five years

  1. Morales A, Gomez D, Solórzano Vargas L.E., Richard J, Orkisz M, Hernandez M. “A novel hybrid registration method: Application to lung segmentation in CT images of subjects with ARDS”. VIII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica Bogota, Colombia. 2016.
  2. Morales A, Orkisz M, Rodriguez C, Torres J, Teillaud S, Sanchez J, Hernandez M. “A Semi-Automatic Method to Extract Canal Pathways in 3D Micro-CT Images of Octocorals”. PLoS ONE (ISSN 1932-6203) 9 (1), pp. e85557-e85557. 2014.
  3. Zuluaga M.A., Hernandez M, Orkisz M. “Feature selection based on empirical-risk function to detect lesions in vascular Computed Tomography images”. IRBM – Innovation and Research in BioMedical Engineering (ISSN 1959-0318) 35 (5), pp. 244-254. 2014.
  4. Richard J, Pouzot C, Morales A, Torres González J, Orkisz M, Neyran B, Hernandez M, Lavenne F, Guerin C. “Reliability of the nitrogen washin-washout technique to assess end-expiratory lung volume at variable PEEP and tidal volumes”. Intensive Care Medicine Experimental (ISSN 2197-425X) 2 (10), pp. 1-10. 2014.
  5. Orkisz M, Hernandez M, Pérez V, Pérez C, Prieto J, Revol-muller C. “Segmentation of the pulmonary vascular trees in 3D CT images using variational region-growing”. IRBM – Innovation and Research in BioMedical Engineering (ISSN 1959-0318) 35 (1), pp. 11-19. 2014.

 

List the most recent professional development activities

  1. 3D vascular image processing: extraction of artery centerlines, detection of “abnormal” sections by use of machine learning techniques, segmentation of calcifications and external boundary of the arterial wall.
  2. Micro CT image processing of corals.

 

Percentage of time available for research or scholarly activities

Teaching 20%, Research 50% and Curricular Committee 30%.

 

Percentage of time committed to the program

100% (Full Time)